با تشکیل وزارت جهادکشاورزی و ادغام دو وزارتخانه جهاد سازندگی و کشاورزی، در سال 1380 این ادغام درسطح شهرستان ها نیز عملی گردید ومدیریت جهادکشاورزی شهرستان اصفهان از ادغام مدیریت کشاورزی شهرستان اصفهان با مدیریت جهاد سازندگی در محل ساختمان سازمان کشاورزی سابق استان فعالیت خود را آغاز نمود.
مديران از زمان تشکیل مدیریت جهادکشاورزی شهرستان اصفهان عبارتند از :
1- یحیی بقایی اردستانی 1384-1380
2- عباس قاسمی رامشه 1386 -1384
3- مهرداد مرادمند 1386 -1395
4-احمدرضا صادقی 1395- 1399
5- همتعلی انصاری 1399- 1401
6- محمد حسین احمدی 1401- تاکنون